O Cadastro Nacional dos Estabelecimentos de Saúde – CNES foi instituído pela Portaria MS/SAS 376, de 03 de outubro de 2000, após acordo na Comissão Intergestores Tripartite.  O cadastro proporciona o conhecimento efetivo de estabelecimentos que cuidam da saúde da população, desde nos grandes centros, até nas mais longínquas localidades, tornando visível esse cenário a toda sociedade, fortalecendo o controle social, permitindo que o profissional tenha até dois vínculos no serviço público e cinco no sistema privado.

O Sistema salva as informações de saúde como base para elaboração do trabalho, tanto no aspecto operacional quanto gerencial, visto que os dados cadastrais se constituem um dos pontos fundamentais para a elaboração da programação, controle e avaliação da assistência hospitalar e ambulatorial no país, assim como a garantia da correspondência entre a capacidade operacional das entidades vinculadas ao SUS e o pagamento pelos serviços prestados.